Mirage 2.0: fast and memory-efficient reconstruction of gene-content evolution considering heterogeneous evolutionary patterns among gene families

Tsukasa Fukunaga*, Wataru Iwasaki

*この研究の対応する著者

研究成果: Article査読

抄録

Summary: We present Mirage 2.0, which accurately estimates gene-content evolutionary history by considering heterogeneous evolutionary patterns among gene families. Notably, we introduce a deterministic pattern mixture model, which makes Mirage substantially faster and more memory-efficient to be applicable to large datasets with thousands of genomes.

本文言語English
ページ(範囲)4039-4041
ページ数3
ジャーナルBioinformatics
38
16
DOI
出版ステータスPublished - 2022 8月 15

ASJC Scopus subject areas

  • 統計学および確率
  • 生化学
  • 分子生物学
  • コンピュータ サイエンスの応用
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  • 計算数学

フィンガープリント

「Mirage 2.0: fast and memory-efficient reconstruction of gene-content evolution considering heterogeneous evolutionary patterns among gene families」の研究トピックを掘り下げます。これらがまとまってユニークなフィンガープリントを構成します。

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